支付宝医保码在进行医保结算的时候是直接从用户的医保账户里面进行扣款的。若是个人医保账户的资金不足的时候就会出现支付宝医保码付款失败的情况。通常情况下我们在交医保的时候,个人缴纳的部分资金是直接进入个人账户的,医保码就是从这部分资金里面扣款的。